生物中的字母G表示鸟嘌呤，字母T表示胸腺嘧啶，其都为构成生物体重要物质的碱基。
在脱氧核糖核酸和核糖核酸中，起配对作用的部分是含氮碱基，共有5种：胞嘧啶、鸟嘌呤、腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶，缩写分别为C、G、A、T、U,其中T为DNA所特有，而U为RNA特有。5种碱基中，腺嘌呤和鸟嘌呤属于嘌呤族，缩写作R，具有双环结构；胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶属于嘧啶族，缩写为Y，环系为一个六元杂环。DNA是通过碱基配对而成，A总与T配对，G总与C配对，沿DNA骨架排列成双螺旋结构。
腺嘌呤与
GT生物化学意思
C-胞嘧啶G-鸟嘌呤T-胸腺嘧啶
_TC对应的是DNA中一个由鸟嘌呤-胸腺嘧啶-胞嘧啶所组成的核苷酸序列，也就是一个密码子。双链DNA：腺嘌呤A的数量等于胸腺嘧啶T的数量，鸟嘌呤G的数量等于胞嘧啶C的数量。碱基互补配对时A-T,C-G，其中A、T通过两个氢键相连，C、G通过三个氢键相连。单链DNA不具有以上关系。
生物中 A G T C 分别是什么
腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胸腺嘧啶（T）和胞嘧啶（C）。它们一起组成脱氧核糖核酸，通常称DNA，DNA携带有合成RNA和蛋白质所必需的遗传信息，是生物体发育和正常运作必不可少的生物大分子。
DNA 分子结构中，两条多脱氧核苷酸链围绕一个共同的中心轴盘绕，构成双螺旋结构。脱氧核糖-磷酸链在螺旋结构的外面，碱基朝向里面。两条多脱氧核苷酸链反向互补，通过碱基间的氢键形成的碱基配对相连，形成相当稳定的组合。
扩展资料：
RNA是以DNA的一条链为模板，以碱基互补配对原则，转录而形成的一条单链，主要功能是实现遗传信息在蛋白质上的表达，是遗传信息向表型转化过程中的桥梁。
一个核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种，即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶，其中，U（尿嘧啶）取代了DNA中的T。
通常从血液、皮肤、唾液、头发和其它组织和体液中分离DNA，以识别罪犯或犯罪行为。常用的遗传指纹识别。该技术比较重复DNA的可变区段的长度，例如短串联重复序列和小卫星，它们在个体之间有不同。
参考资料：
参考资料：
aucgt分别叫什么
A.腺嘌呤，U.尿嘧啶，C.胞嘧啶，G.鸟嘌呤，T.胸腺嘧啶。
这些实际上是碱基类型，RNA是单链结构，碱基类型只有A.C.G.U，DNA是双链结构，碱基类型只有A.C.G.T，一个DNA或RNA分子只有一个碱基。以上是生物遗传学的一些常识和基础定义。
碱基指嘌呤和嘧啶的衍生物，是核酸、核苷、核苷酸的成分。DNA和RNA的主要碱基略有不同，其重要区别是：胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱，在RNA中极少见；相反，尿嘧啶是RNA的主要嘧啶碱，在DNA中则是稀有的。
海钓gt什么意思，或者鱼类GT什么意思？
海钓GT是指牛港鲹，鱼类GT的意思也是牛港鲹。
海钓中的GT就是牛港鲹。台湾名称 :牛港鲹、牛港瓜仔、牛公瓜仔、流氓瓜仔 。体呈卵圆形，侧扁而高，随着成长，身体逐渐向后延长。头背部强度弯曲，头腹部则几乎呈直线。
脂性眼睑普通发达，前部达眼之前缘，后部达瞳孔后缘，留下略呈半圆的缝隙。吻钝。上颌末端延伸至瞳孔后缘。
海钓的主要对象是鲈鱼、黄鱼、鳕鱼、带鱼、石斑鱼、鳗鱼等，由于海中的鱼类是咸水鱼类，它们比淡水鱼类更凶猛，更加贪吃，因此有利于钓鱼的收获量。
扩展资料
牛港鲹第二背鳍与臀鳍同形，前方鳍条呈弯月形，不延长为丝状。体背蓝绿色，腹部银白色。各鳍淡色至淡黄色。鳃盖后缘不具任何黑斑，体侧亦无任何斑纹。
近沿海洄游性鱼类。成鱼多单独栖息于具清澈水质的泻湖或向海的礁区； 幼鱼常出现于河口区域。主要在夜晚觅食，以甲壳类如螃蟹类，龙虾类及鱼类为对象。
广泛分布于印度-西太平洋之热带及亚热带海域，西起非洲东岸，东至夏威夷群岛，北自日本南部，南迄澳洲北部海域。本省各沿岸经常可见其踪迹。
参考资料来源：百度百科-GT （牛港鲹）
GT是什么化学试剂
比较广，但是没有具体的分类，他是取名在化学试剂名称中的字母，有些化学试剂名字中有。
比如：γ--谷氨酰转肽酶(γ-GT)活性检测试剂。
化学试剂：
实验试剂：缩写为LR，又称四级试剂。
化学纯试剂：缩写为CP，又称三级试剂，一般瓶上用深蓝色标签。
分析纯试剂：缩写为AR，又称二级试剂，一般瓶上用红色标签。
保证试剂：缩写为GR，又称一级试剂，一般瓶上用绿色标签（又称优级纯）
基准试剂：缩写为PT,专门作为基准物用，可直接配置标准溶液。
光谱纯试剂：缩写为SP，表示光谱纯净。但由于有机物在光谱上显示不出，所以有时主成分达不到99.9%以上，使用时必须注意，特别是作基准物时，必须进行标定。
其他的有：
AAS 原子吸收光谱
AR 分析纯试剂
BC 生化试剂
BP 英国药典
BR 生物试剂
BS 生物染色剂
CP 化学纯
CR 化学试剂
EP 特纯
FCP 层析用
FMP 显微镜用
FS 合成用
GC 气相色谱
GR 优级纯试剂
HPLC 高压液相色谱
Ind 指示剂
IR 红外吸收光谱
LR 实验试剂
MAR 微量分析试剂
NMR 核磁共振光谱
OAS 有机分析标准
PA 分析用
Pract 实习用
PT 基准试剂
Puriss 特纯
Purum 纯
SP 光谱纯
Tech 工业用
TLC 薄层色谱
UP 超纯
USP 美国药典
UV 紫外分光光度纯
检验报告中lt和gt是什么意思
检查报告中的lt就是LESSTHAN小于意思是小于，gt就是GREATERTHAN大于意思是大于。具体根据你检查的项目来看，看检验的项目后面有对应正常的值。这就是检验报告中lt和gt的意思。
人教版的高一生物教科书上写核酸的那一节里表示核酸结构的AUCGT分别代表什么？
A.腺嘌呤
G.鸟嘌呤
C.胞嘧啶
T.胸腺嘧啶
U.尿嘧啶
这些实际上是碱基类型.
RNA是单链结构,碱基类型只有A.C.G.U.
DNA是双链结构,碱基类型只有A.C.G.T.
一个DNA或RNA分子只有一个碱基.
以上是生物遗传学的一些常识,没有为什么.
如果要归根结底那就去问那些科学家吧...
有谁知道碳储量的单位Gt、Pg是什么意思？
这个问题我也查过很多次，查完了不久就忘记了，今天看文章又看到了，仔细查了一下。解释如下：
Mg，Gg，Tg，Pg，Gt等等都来源于英文单位的缩写，1Mg=1 Megagram，也就是一百万克，也通常可以翻译为1 兆，1 Gg=1 Gigagram，也可以翻译成1千兆，这个也是现在电脑硬盘的常用单位，大家也比较了解了。1 Tg=1 Teragram，翻译成1兆兆，也就是10^12次方，或者说一万亿；1 Pg=1 Petagram，也就是10的15次方g的碳，大家都知道1Mg=1 Ton（吨）的碳，所以说1 Pg的碳=1 Gt的碳。
其实只要知道了所谓M（Mega）、G（Giga）、T（Tera）、P（Peta）的英文含义，不论后面是与g （gram，克）组合还是与 t（ton，吨）组合，其含义都很好理解了。
另外还需要注意一点的就是：电脑中用的单位和碳循环中用的单位有一点区别，具体如下：
计算机存储信息的最小单位，称之为位（bit，又称比特）
存储器中所包含存储单元的数量称为存储容量，其计量基本单位是字节（Byte。简称B），8个二进制位称为1个字节，此外还有KB、MB、GB、TB等，它们之间的换算关系是1Byte＝8bit，1KB=1024B，1MB=1024KB，1GB=1024MB，1TB=1024GB。（引自http://iask.sina.com.cn/b/11717701.html）
我们通常用的硬盘如果是500G的，但是实际你在电脑中查看容易不够500G，只有466G，左右，这是因为硬盘空间的换算是按1024来的，而不是1000。
怎样拿到生物基因数据文件
1.什么是vcf文件
VCF是用于描述SNP（单个碱基上的变异），INDEL（插入缺失标记）和SV（结构变异位点）结果的文本文件。在GATK软件中得到最好的支持，当然SAMtools得到的结果也是VCF格式，和GATK的CVF格式有点差别。
2.VCF的主体结构
##fileformat=VCFv4.2
##fileDate=20090805
##source=myImputationProgramV3.1
##reference=file:///seq/references/1000GenomesPilot-NCBI36.fasta
##contig=<ID=20,length=62435964,assembly=B36,md5=f126cdf8a6e0c7f379d618ff66beb2da,species="Homo sapiens",taxonomy=x>
##phasing=partial
##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of Samples With Data">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency">
##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=String,Description="Ancestral Allele">
##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership, build 129">
##INFO=<ID=H2,Number=0,Type=Flag,Description="HapMap2 membership">
##FILTER=<ID=q10,Description="Quality below 10">
##FILTER=<ID=s50,Description="Less than 50% of samples have data">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
##FORMAT=<ID=HQ,Number=2,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT NA00001 NA00002 NA00003
14370 rs6054257 G A 29 PASS NS=3;DP=14;AF=0.5;DB;H2 GT:GQ:DP:HQ 0|0:48:1:51,51 1|0:48:8:51,51 1/1:43:5:.,.
17330 . T A 3 q10 NS=3;DP=11;AF=0.017 GT:GQ:DP:HQ 0|0:49:3:58,50 0|1:3:5:65,3 0/0:41:3
1110696 rs6040355 A G,T 67 PASS NS=2;DP=10;AF=0.333,0.667;AA=T;DB GT:GQ:DP:HQ 1|2:21:6:23,27 2|1:2:0:18,2 2/2:35:4
1230237 . T . 47 PASS NS=3;DP=13;AA=T GT:GQ:DP:HQ 0|0:54:7:56,60 0|0:48:4:51,51 0/0:61:2
1234567 microsat1 GTC G,GTCT 50 PASS NS=3;DP=9;AA=G GT:GQ:DP 0/1:35:4 0/2:17:2 1/1:40:3123456789101112131415161718192021222324
从范例上看，VCF文件分为两部分内容：以“#”开头的注释部分；没有“#”开头的主体部分。
值得注意的是，注释部分有很多对VCF的介绍信息。实际上不需要本文章，只是看看这个注释部分就完全明白了VCF各行各列代表的意义。
主体部分中每一行代表一个Variant的信息。
3.怎么解释Variation
CHROM：表示变异位点是在哪个contig 里call出来的，如果是人类全基因组的话那就是chr1…chr22，chrX,Y,M。
POS： 变异位点相对于参考基因组所在的位置，如果是indel，就是第一个碱基所在的位置。
ID： variant的ID。 如果call出来的SNP存在于dbSNP数据库里，就会显示相应的dbSNP里的rs编号；若没有，则用’.’表示其为一个novel variant。
REF和ALT： 在这个变异位点处，参考基因组中所对应的碱基和研究对象基因组（Variant）中所对应的碱基。
QUAL： Phred格式(Phred_scaled)的质量值，可以理解为所call出来的变异位点的质量值。表 示在该位点存在variant的可能性；该值越高，则variant的可能性越大；
计算方法：① Q=-10*lgP，Q表示质量值；P表示这个位点发生错误的概率。
②Phred值Q = -10 * lg (1-p) ，p为variant存在的概率;
通过计算公式可以看出值为10的表示错误概率为0.1，该位点为variant的概率为90%。
同理，当Q=20时，错误率就控制在了0.01。
FILTER： 使用上一个QUAL值来进行过滤的话，是不够的。理想情况下，QUAL这个值应该是用所有的错误模型算出来的，这个值就可以代表正确的变异位点了，但是事实是做不到的。因此，还需要对原始变异位点做进一步的过滤。无论你用什么方法对变异位点进行过滤，过滤完了之后，在FILTER一栏都会留下过滤记录，如果是通过了过滤标准，那么这些通过标准的好的变异位点的FILTER一栏就会注释一个PASS，如果没有通过过滤，就会在FILTER这一栏提示除了PASS的其他信息。如果这一栏是一个“.”的话，就说明没有进行过任何过滤。
INFO： 这一行是variant的详细信息，内容很多，以下再具体详述。
例子：
##fileformat=VCFv4.0
##FILTER= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##UnifiedGenotyperV2="analysis_type=UnifiedGenotyperV2 input_file=[TEXT CLIPPED FOR CLARITY]"
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT NA12878
chr1 873762 . T G 5231.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=315;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=15.11;MQ=91.05;MQ0=15;QD=16.61;SB=-1533.02;VQSLOD=-1.5473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,141:282:99:255,0,255
chr1 877664 rs3828047 A G 3931.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.59;MQ=92.52;MQ0=4;QD=37.44;SB=-1152.13;VQSLOD= 0.1185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:94:99:255,255,0
chr1 899282 rs28548431 C T 71.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DB;DP=4;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.00;MQ=99.00;MQ0=0;QD=17.94;SB=-46.55;VQSLOD=-1.9148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25.92:103,0,26
chr1 974165 rs9442391 T C 29.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DB;DP=18;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.16;MQ=95.26;MQ0=0;QD=1.66;SB=-0.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:14:60.91:61,0,2551234567
到现在，我们就可以解释上面的例子：
chr1：873762 是一个新发现的T/G变异，并且有很高的可信度（qual=5231.78）。
chr1：877664 是一个已知的变异为A/G 的SNP位点，名字rs3828047，并且具有很高的可信度（qual=3931.66）。
chr1：899282 是一个已知的变异为C/T的SNP位点，名字rs28548431，但可信度较低（qual=71.77）。
chr1：974165 是一个已知的变异为T/C的SNP位点，名字rs9442391，但是这个位点的质量值很低，被标 成了“LowQual”，在后续分析中可以被过滤掉。
FORMAT 和 NA12878：这两行合起来提供了’NA12878′这个sample的基因型的信息。’NA12878′代表这该名称的样品，是由BAM文件中的@RG下的 SM 标签决定的。
Vcf文件看起来很复杂，挺吓人的样子，但是里面大部分都是一些tags，而这些tags基本上都是在VASR中过滤用的，能够理解每个tags的意思最好，如果实在不理解也就不用管了。其实最关键的信息也就是那么几列：
chr1 873762 . T G [CLIPPED] GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,141:282:99:255,0,255
chr1 877664 rs3828047 A G [CLIPPED] GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:94:99:255,255,0
chr1 899282 rs28548431 C T [CLIPPED] GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25.92:103,0,26
其中最后面两列是相对应的，每一个tag对应一个或者一组值，如：
chr1：873762，GT对应0/1；AD对应173,141；DP对应282；GQ对应99；PL对应255,0,255。
GT： 表示这个样本的基因型，对于一个二倍体生物，GT值表示的是这个样本在这个位点所携带的两个等位基因。0表示跟REF一样；1表示表示跟ALT一样；2表示第二个ALT。当只有一个ALT 等位基因的时候，0/0表示纯和且跟REF一致；0/1表示杂合，两个allele一个是ALT一个是REF；1/1表示纯和且都为ALT； The most common format subfield is GT (genotype) data. If the GT subfield is present, it must be the first subfield. In the sample data, genotype alleles are numeric: the REF allele is 0, the first ALT allele is 1, and so on. The allele separator is ‘/’ for unphased genotypes and ‘|’ for phased genotypes.
0 - reference call
1 - alternative call 1
2 - alternative call 2
AD： 对应两个以逗号隔开的值，这两个值分别表示覆盖到REF和ALT碱基的reads数，相当于支持REF和支持ALT的测序深度。
DP： 覆盖到这个位点的总的reads数量，相当于这个位点的深度（并不是多有的reads数量，而是大概一定质量值要求的reads数）。
PL:对应3个以逗号隔开的值，这三个值分别表示该位点基因型是0/0，0/1，1/1的没经过先验的标准化Phred-scaled似然值（L）。这三种指定的基因型(0/0,0/1,1/1)的概率总和为1。如果转换成支持该基因型概率（P）的话，由于L=-10lgP，那么P=10^（-L/10），因此，当L值为0时，P=10^0=1。因此，这个值越小，支持概率就越大，也就是说是这个基因型的可能性越大。
GQ： 表示最可能的基因型的质量值。表示的意义同QUAL。Phred格式(Phred_scaled)的质量值，表示在该位点该基因型存在的可能性；该值越高，则Genotype的可能性越 大；计算方法：Phred值 = -10 * log (1-p) p为基因型存在的概率。
举个例子说明一下：
chr1 899282 rs28548431 C T [CLIPPED] GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25.92:103,0,261
在这个位点，GT=0/1，也就是说这个位点的基因型是C/T；GQ=25.92，质量值并不算太高，可能是因为cover到这个位点的reads数太少，DP=4，也就是说只有4条reads支持这个地方的变异；AD=1,3，也就是说支持REF的read有一条，支持ALT的有3条；在PL里，这个位点基因型的不确定性就表现的更突出了，0/1的PL值为0，虽然支持0/1的概率很高；但是1/1的PL值只有26，也就是说还有10^(-2.6)=0.25%的可能性是1/1；但几乎不可能是0/0，因为支持0/0的概率只有10^(-10.3)=5*10-11。
VCF第8列的信息
该列信息最多了，都是以 “TAG=Value”,并使用”;”分隔的形式。其中很多的注释信息在VCF文件的头部注释中给出。以下是这些TAG的解释
AC，AF 和 AN：AC(Allele Count) 表示该Allele的数目；AF(Allele Frequency) 表示Allele的频率； AN(Allele Number) 表示Allele的总数目。对于1个diploid sample而言：则基因型 0/1 表示sample为杂合子，Allele数为1(双倍体的sample在该位点只有1个等位基因发生了突变)，Allele的频率为0.5(双倍体的 sample在该位点只有50%的等位基因发生了突变)，总的Allele为2； 基因型 1/1 则表示sample为纯合的，Allele数为2，Allele的频率为1，总的Allele为2。
DP： reads覆盖度。是一些reads被过滤掉后的覆盖度。
Dels： Fraction of Reads Containing Spanning Deletions。进行SNP和INDEL calling的结果中，有该TAG并且值为0表示该位点为SNP，没有则为INDEL。
FS：使用Fisher’s精确检验来检测strand bias而得到的Fhred格式的p值。该值越小越好。一般进行filter的时候，可以设置 FS < 10～20。
HaplotypeScore： Consistency of the site with at most two segregating haplotypes
InbreedingCoeff： Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hard-Weinberg expectation
MLEAC： Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts (not necessarily the same as the AC), for each ALT allele, in the same order as listed
MLEAF： Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency (not necessarily the same as the AF), for each ALT alle in the same order as listed
MQ： RMS Mapping Quality
MQ0： Total Mapping Quality Zero Reads
MQRankSum： Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities
QD： Variant Confidence/Quality by Depth
RPA： Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)
RU： Tandem repeat unit (bases)
ReadPosRankSum： Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias
STR： Variant is a short tandem repeat
VCF (Variant Call Format) version 4.1
The VCF specification is no longer maintained by the 1000 Genomes Project. The group leading the management and expansion of the format is the Global Alliance for Genomics and Health Data Working group file format team, http://ga4gh.org/#/fileformats-team
The main version of the specification can be found on https://github.com/samtools/hts-specs
This is under continued development, please check the hts-specs page for the most recent specification
A PDF of the v4.1 spec is http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.1.pdf
A PDF of the v4.2 spec is http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf
VCFTools host a discussion list about the specification called vcf-spec http://sourceforge.net/p/vcftools/mailman/
REF:
http://blog.sina.com.cn/s/blog_12d5e3d3c0101qv1u.html
http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf
http://samtools.github.io/bcftools/bcftools.html
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生物中G1，G2，M，S期是什么意思
LZ您好
这些字母说的是有丝分裂/减数第一次分裂间期/分裂期
G1是分裂间期的第一个阶段，这个时候细胞会装配染色体蛋白质部分，和形成染色体旋解酶
S是分裂间期的第二个阶段，这个时候细胞在复制DNA
G2是间期第三个阶段，这个时候细胞装配分裂过程，还有纺锤丝需要的蛋白质。
M一般只指有丝分裂的分裂期，又包含前，中，后，末4个阶段
减数第一次分裂的间期也有G1、S、G2阶段，但减数第二次分裂的间期没有S期
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