和小说一样，网剧也采用了倒叙，虽然在故事的开头白宇饰演的江阳死了，但故事依然是以他为主线，讲在过去他是怎样为了真相和光明而斗争的，在江阳追寻真相的过程中，很多人都和他一起并肩作战。
江阳要查的，是很多年前的一桩案子，他的同学侯贵平，在支教的过程中，为保护学生被犯罪集团冤枉致死，当时结案的结论是侯贵平是畏罪自杀，但实际上，侯贵平是被人杀死的。
侯贵平班上的学生，被胁迫去接待客人，女孩不甘心被威胁，在失去贞洁之后选择了自杀，自杀之后，侯贵平向警方报案，并且自己也开始调查事情的真相，可是没有想到，他拍到了很重要的证据，可是照片却被人拿走了。
再往后就侯贵平被冤枉，甚至是被杀害，侯贵平的女朋友李静找到了侯贵平的同学江阳，江阳是检察官，前途一片光明，可就是因为他插手了侯贵平的案件，前途尽毁。
就因为调查这个案子，江阳最后落得了一个“收受贿赂”的罪名，大好前途没有了，女朋友另嫁他人，江阳自己也入狱了。
刑满出狱的江阳只能依靠手机维修度日，虽然生活艰难但江阳依然保持着一颗乐观之心，也依然没有放弃追求正义。
江阳在知道自己身患癌症之后，将当年所有的人召集在一起，想做最后一件事以求得真相和正义。他们一起布局，试图通过一场能轰动全国的“大案件"获得舆论的注意力，当初的李静、张超、陈明章，他们都参与了这件事，目的就是为了引起关注，从而查出当初的真相。
幸运的是，他们遇到的是严良，一个找不到真相誓不罢休的警察，最后，不管是害死侯贵平的卡恩集团，还是后来陷害江阳的幕后黑手，都受到了应有的惩罚，但真正的“大人物”，却依旧没能落网，这正是“长夜难明”。
其实真相很简单，不管是侯贵平还是江阳，他们都惹了不该惹的人，所以被打击报复，但是，真相总有大白的一天，是江阳等人的坚持，才换来了最后的结局。
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